Etyleenioksidi tunnetaan laajakirjoisena ja erittäin tehokkaana kaasumaisena desinfiointiaineena, vielä se aiheuttaa merkittävää haittaa ihmisten terveydelle, joiden myrkyllisyystasot ylittävät kloroformin ja hiilitetrakloridin tasot.
Aluksi, se kohdistuu hengitysteihin, aiheuttaa oireita, kuten pahoinvointia, oksentelua, ripuli, ja kipua, yhdessä keskushermoston tukahduttamisen kanssa. Vakavissa tapauksissa, se voi kärjistyä hengitysvaikeudeksi ja keuhkoödeemaksi.