Myrkyllisyydestä puhuminen ilman viittausta annokseen on harhaanjohtavaa; puhdas butaani on luonnostaan myrkytön. Vaikka butaani ei metaboloidu ihmiskehossa, jatkuva altistuminen korkeille tasoille voi tunkeutua verenkiertoelimistöön, mahdollisesti muuttaa säännöllisiä aineenvaihduntatoimintoja.
Kun butaania hengitetään, se kulkee keuhkoihin, missä se imeytyy ja vaikuttaa sitten aivoihin, tukahduttaa keskushermostoa. Pieni altistuminen voi aiheuttaa oireita, kuten huimausta, päänsäryt, ja näön hämärtyminen. Verrattuna, merkittävä altistuminen voi johtaa tajuttomuuteen.