Etilen oksida dikenal sebagai disinfektan gas berspektrum luas dan sangat efektif, belum itu menimbulkan bahaya yang signifikan bagi kesehatan manusia, menunjukkan tingkat toksisitas melebihi kloroform dan karbon tetraklorida.
Mulanya, itu menargetkan saluran pernapasan, menyebabkan gejala seperti mual, muntah, diare, dan rasa sakit, bersamaan dengan penekanan sistem saraf pusat. Dalam kasus yang parah, hal ini dapat meningkat menjadi gangguan pernapasan dan edema paru.