Tetraidrotiofene, riconosciuto per la sua tossicità, rientra nella categoria delle sostanze chimiche pericolose. È incline a decomporsi in sostanze tossiche se la temperatura di stoccaggio supera i 220°C.
Data la notevole disparità nella solubilità tra alcani a catena lineare e composti aromatici, le unità di estrazione aromatiche sono comunemente impiegate come agenti di estrazione. Tali reagenti trovano utilizzo parallelo anche negli ambienti di laboratorio.