Етилен оксидот е препознаен како гасовито средство за дезинфекција со широк спектар и високо ефективно, уште тоа претставува значителна штета за здравјето на луѓето, покажувајќи нивоа на токсичност што ги надминуваат оние на хлороформ и јаглерод тетрахлорид.
На почетокот, тоа е насочено кон респираторниот тракт, предизвикувајќи симптоми како гадење, повраќање, дијареа, и болка, заедно со супресија на централниот нервен систем. Во тешки случаи, може да ескалира до респираторен дистрес и пулмонален едем.