O tetrahidrotiofeno, reconhecido pela sua toxicidade, pertence à categoria dos produtos químicos perigosos. É suscetível de se decompor em substâncias tóxicas se a temperatura de armazenamento for superior a 220°C.
Dada a considerável disparidade de solubilidade entre os alcanos de cadeia linear e os compostos aromáticos, as unidades de extração aromáticas são normalmente utilizadas como agentes de extração. Estes reagentes também são utilizados em paralelo em ambientes laboratoriais.