Tetrahidrotiofeno, reconhecido por sua toxicidade, se enquadra na categoria de produtos químicos perigosos. É propenso a se decompor em substâncias tóxicas se a temperatura de armazenamento ultrapassar 220°C.
Dada a disparidade considerável na solubilidade entre alcanos de cadeia linear e compostos aromáticos, unidades de extração aromáticas são comumente empregadas como agentes de extração. Esses reagentes também encontram uso paralelo em ambientes de laboratório.