Je známe, že butadién má toxické vlastnosti.
Pri vdýchnutí, jednotlivci môžu pociťovať príznaky ako bolesti hlavy, nevoľnosť, a závraty. V prípade náhodného vdýchnutia butadiénu, je nevyhnutné okamžite opustiť okolie a vyhľadať oblasť s čistým vzduchom.