Etylenoxid är erkänt som ett brett spektrum och mycket effektivt gasformigt desinfektionsmedel, men den utgör en betydande risk för människors hälsa och uppvisar toxicitetsnivåer som överstiger dem för kloroform och koltetraklorid.
Inledningsvis riktar den in sig på luftvägarna och framkallar symtom som illamående, kräkningar, diarré och smärta samt dämpning av det centrala nervsystemet. I allvarliga fall kan det eskalera till andningsbesvär och lungödem.