Etylenoxid är erkänt som ett brett spektrum och mycket effektivt gasformigt desinfektionsmedel, ännu det utgör betydande skada på människors hälsa, uppvisar toxicitetsnivåer som överstiger de för kloroform och koltetraklorid.
Initialt, den riktar sig mot luftvägarna, inducerar symtom som illamående, kräkningar, diarre, och smärta, tillsammans med dämpning av centrala nervsystemet. I svåra fall, det kan eskalera till andnöd och lungödem.