เอทิลีนออกไซด์ได้รับการยอมรับว่าเป็นสารฆ่าเชื้อโรคในวงกว้างและมีประสิทธิภาพสูง, ยัง มันก่อให้เกิดอันตรายอย่างมากต่อสุขภาพของมนุษย์, มีระดับความเป็นพิษสูงกว่าคลอโรฟอร์มและคาร์บอนเตตราคลอไรด์.
เริ่มแรก, มันมุ่งเป้าไปที่ระบบทางเดินหายใจ, ทำให้เกิดอาการเช่นคลื่นไส้, อาเจียน, ท้องเสีย, และความเจ็บปวด, พร้อมกับการปราบปรามระบบประสาทส่วนกลาง. ในกรณีที่รุนแรง, อาจลุกลามไปสู่ภาวะหายใจลำบากและปอดบวม.