Etilen oksit geniş spektrumlu ve oldukça etkili bir gaz dezenfektanı olarak kabul edilmektedir, ancak kloroform ve karbon tetraklorürden daha yüksek toksisite seviyeleri sergileyerek insan sağlığına önemli ölçüde zarar verir.
Başlangıçta solunum yollarını hedef alır ve merkezi sinir sistemi baskılanmasıyla birlikte bulantı, kusma, ishal ve ağrı gibi semptomlara neden olur. Şiddetli vakalarda, solunum sıkıntısı ve akciğer ödemine kadar tırmanabilir.