Ethylene oxit được công nhận là chất khử trùng dạng khí phổ rộng và hiệu quả cao, chưa nó gây ra tác hại đáng kể cho sức khỏe con người, thể hiện mức độ độc tính vượt quá mức của cloroform và carbon tetrachloride.
Ban đầu, nó nhắm vào đường hô hấp, gây ra các triệu chứng như buồn nôn, nôn mửa, tiêu chảy, và nỗi đau, cùng với sự ức chế hệ thần kinh trung ương. Trong những trường hợp nặng, nó có thể leo thang đến suy hô hấp và phù phổi.